ポケモンスリープ攻略・検証Wiki

3人とも強い子ですね！　悩むお気持ちもわかります
まずミュウツーを1週間出ずっぱりにするか、ゾーンを溜めてからクレセリア等に交代するかで採用基準が変わると思います
それから、ミュウツーの育成スパンをどれくらいで捉えているかですね

・ミュウツーをレベル30→70にあげるだけで、アメが5000個必要です　すべてミニアメブで済ませる場合は、ミニアメブ約7週分必要になります
・ミュウツーを寝かせればその分育成は早まりますが、その間、他のとくべつなポケモンには睡眠EXPを入れられません
→レベル70（あるいはそれ以上）で本領発揮するミュウツーを育てる場合、その間に他のポケモンを育てることはかなり難しくなる、と思っていた方がいいと思います
（ホリデーアメブを利用する選択肢もありますが、その場合今度はかけらがエグい量要求されます……）

個人的には早熟で完成する②の子がすなおに強いと思います
ただ、②の子を育てたあとも「他の子にしておけばなあ」という後悔が消えないとは言い切れませんので、添い遂げる覚悟をするなら、私ならきのみSのある①の子ですかね
悩ましいですが、レベル80で比較しても、②と③で1回くらいしか日中スキル発動数が変わらないので、その程度の差なら②を80まであげる必要は薄いかなあと

クレセ等の交代先がいる→②
交代先がおらず、ミュウツーをメインに使う→①
ですかねえ
③の子も確かに強いのですが、スキ確盛りミュウツーのやることはさっさとゾーンを張って他ポケモンと交代することなので、そちらのポケモンのレベルもあげないといけないと考えると、ミュウツーを80まであげきるのがキツいな〜という感想です