Stellaris日本語wiki

ゲレボー変異は、とある考古学調査地点で得られるテクノロジー、「万能マクロファージ」が起点となり、研究完了からしばらくしてから発生します。

これを防ぐ方法としては、まず第一に「万能マクロファージ」を研究しないことです。
研究選択肢として残しつつ手動で研究しないという方法もありますが、考古学調査地点を発掘完了時に「万能マクロファージ」の研究選択肢を獲得するか否かの選択肢が得られるので、テクノロジーを獲得しない方の選択肢を選びましょう。

防ぐ第二の方法に「万能マクロファージ」を研究する前に、遺伝子系のアセンションパスを完了させるというものがあり、これにより「万能マクロファージ」研究後もゲレボー変異が発生しなくなります。
将来、遺伝子系のアセンションパスを選択する場合なら、研究選択肢としてあえて残し、アセンションパス完了を待ってから研究しましょう。