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TakJP様
「POS(緑線)の当該値の前後1.1秒の移動平均値」です。どうやってもジャンプした個所から遡ってスムーズな軌跡が描けなかったのとGPS値を参考にしてしまうとbinファイルから手を付けることになるのでシンプルに考えました。ジャンプしてないように見えれば良い訳けですから。
20年ほど前にVB6でバイナリファイルを触ったことがある程度の素人ですが最近の言語を検索しているとLUAかPythonが出てくるのでardupilotでも使えそうなLUAを試そうかと思っていましたがお勧めはPythonですか、ちょっと考えなおしてみます。今後もアドバス頂けましたらうれしいです。