ライブ・ア・ヒーロー！

やはりそこの解釈次第ですかね。
放サモのイメージに引っ張られてるというのは確かにありそうです。
「介在者」に何をされたのかは、断片的ですが1部4章13話でメリデが「観測者」の成り立ちについて言及していて、そこでは一応「異なる宇宙に存在する2人のニンゲンを1人に統合」と明記されています。
ただ「特別製」の文言がある限り、主人公もその通りと言い切れはしないですね。

あと「統合」というのも個々人や状況で意味が揺れている気がするので個人的解釈をまとめてみる（自分用）
・1部4章13話、↑のメリデの言葉の続きとして「魂を引き裂いたら元の世界にいる人格も死んでしまう」とある。つまり通常の観測者は繋がっている並行存在がそれぞれの宇宙で生きて生活しており、生き霊のようなものが入っている、または深層意識で繋がっている状態と思われる
・対して、多くの人が主人公統合説で考えているのは放サモの追放者のような「並行存在は主人公と融合しており、すでに消滅している」状態だろうか。ゼノアカシの幼馴染の状況が他の消滅した人と違うことから信憑性が上がっている気が…やだ信じたくないこれ以上考えたくない

他にも、エクシオを使った実験が全ての並行存在とリンクって内容だったのが大きいと思う。あれを経たブローカーが「じゃあ混ぜちゃおう」って考えるのは十分ありうると思う

繋がっている並行存在がそれぞれの宇宙で生きて生活している

これは根拠となる記述まではない持論ですが、2020年代を生きた記憶を持つ「送り込まれた側の人格」が「プレイヤー自身」を指すとしたら、これも満たせると思うんですよね。
プレイヤーはゲーム内で主人公であるのと同時に当然、ゲーム外の世界(別の宇宙)を生きていると言えますから。
介在者の「外からの観測者、内からの観測者と2つの側面を併せ持った」という意味深な発言も、こう考えるとしっくりこないかなと。