ポケモンスリープ攻略・検証Wiki

いやしのはどうーラティアスメインスキル検証（EXCELスプレッドシート）
結果の部分だけを切り取ればこういう感じです

まず一回目スキル発動の一体目、二体目回復をそれぞれ1-1、1-2とする。二回目発動は2-1と2-2。

1-1：一番シンプル。wikiの記載によると推定60%から一回強化されたらしい。多分70%くらいは合ってる
1-2：残りの対象から元気が少ないポケモンを選んでくれるようです。対象が4匹だけになる分、命中率少し上がった？多分誤差の範囲内だから何とも言えないかな
2-1：1回目回復の変化が反映されるように見えます。命中率低めなのは気になりますが、二連発のサンプル数は少ないし、ただの下振れかな？それとも何か別の条件があるのかな……
2-2：こちらも元気の変化が反映されるようですね

前には他の方が朝一発動について検証してくれましたが、寝る前の元気を参照する可能性が高いです。
自分は朝一をデータから排除しましたが、寝る前に元気が減ってるポケモンが当たることが多いです。

この二点を合わせて考えたら、恐らく「発動する時点で対象を決める」ではなく、「予め一回目回復後の元気を計算し、それに基づいて二回目の対象を決める」という仕様ではないかと思います。
少なくとも「二連発になったら対象が被りやすい」みたいな心配はないらしいです。どうやらそこを配慮して仕様を調整してくれたらしいです。所々バラけていて使いやすい感じですね。