Do I need to buy Escape from Tarkov on Steam if I already own it through the Battlestate Games launcher or website?
Answer: Yes. To play Escape from Tarkov through Steam, you must purchase any edition of the game on Steam. You can then link your existing Battlestate Games account with an active copy of the game to your Steam profile. If the editions differ, it will automatically use the higher edition of the two when launching the game through Steam.
販売するプラットフォームが違うのでそうです。
公式のFAQを引用しますと、以下のようになります
つまり、Steamで遊びたい場合は、現在遊んでいるBSGアカウントとSTEAMを連携させた後で、一番安いエディションでいいので購入する必要があります。Steam版とBSG版でエディションが異なる場合は、自動的に上位のエディションが適用されるとのことです。
その他のFAQに関してはこちらをご確認ください。